Diatomées benthiques

En 2016, une étude sur les diatomées benthqiues dans les lacs d'altitude a permis de reflechir à un protocole.

Les diatomées benthiques sont des algues constituées d'une unique cellule, donc de taille microscopique, vivant dans l'eau soit en suspension (diatomées pélagiques) soit sur le fond (diatomées benthiques). Leur originalité ainsi que leur beauté résident dans le fait que la cellule possède une enveloppe, appelée frustule, transparente et rigide car constituée de silice. Ce frustule est semblable à une boîte, dont le fond et le couvercle, appelés valves, portent des ornementations d'une extrême finesse.
Les diatomées sont utilisées comme indicateur de la qualité des eaux douces continentales.

La vidéo suivante, postée par Frédéric RIMET (INRA de Thonon) présente le protocole de prélèvement de diatomées benthiques en lac dans le cadre d'une évaluation environnementale. La fixation à l'éthanol à plus de 75% permet une analyse par barcoding ADN.

Vous pouvez la visionner en cliquant sur le lien suivant :

vidéo de prélèvement des diatomées bentiques pour metabarcoding ADN

Protocole_LS-2016-Diatomees.pdf